南神门位于大山门南面正对，火池以北，与门内东、西神门共同围成了碧霞祠前院。石砌方形，顶部条石平铺。门宽2.7米，进深5.26米，高2.73米，东西各有小房一间，门相对。

门上有歌舞楼， 3间面，阔9.79米，进深4.95米， 通高4.9米，两柱六檩六架梁，重梁起架，卷棚歇山顶，东西山顶各开一拱形门， 北面无壁。檐檩垫板等施墨线小点金彩绘。

南神门与东西神门之间各有北向小房间，顶部铺条石，将东西阁楼和歌舞楼连在一起，有石阶相通。